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データベース

データベース名	概要	関連論文	担当	調査結果
NCBI	Bioinformatics Center
EMBL	Bioinformatics Center
PubMed	Biomedical literature
GenBank	Nucleic acid sequence
SRS at EMBL/EBI	Nucleic acid sequence
Entrez Genome	Genome sequence
TIGR database	Genome sequence
GenBank (protein)	Protein sequence
SWISS-PROT at ExPASy	Protein sequence
PIR	Protein sequence	http://pir.georgetown.edu/pirwww/aboutpir/publication.html	http://pir.georgetown.edu/pirwww/aboutpir/publication.html
Protein Data Bank	Protein sequence
RESID	Post-translational modifications	http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/resid.html	http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/resid.html
ENZYME	Biochemical and biophysical information
BIND	Biochemical and biophysical information
KEGG	Biochemical pathways	http://www.genome.ad.jp/kegg/kegg1.html
OMIM	Disorders Database
LocusLink	Gene information
PubGene	MedLineから自動抽出したヒトイデンッし発現量DB	http://www.nature.com/nglink/v28/n1/abs/ng0501_21.html	http://www.nature.com/nglink/v28/n1/abs/ng0501_21.html
PartsList	アミノ酸立体構造予測	http://nar.oupjournals.org/cgi/content/abstract/29/8/1750	http://nar.oupjournals.org/cgi/content/abstract/29/8/1750
InterPro	プロテオーム関連DB	http://www.ebi.ac.uk/interpro/nar_interpro.pdf	http://www.ebi.ac.uk/interpro/nar_interpro.pdf
FullLengthcDNA	HumanのFull Length cDNA8000本
ATCC	STR(Short Tandem Repeat) and cDNA database
World data centre for Microorganisms	Microbial database
JFCCバクテリア、ウイルス	Culture collection
NCCB	mutant strains
SRS	EMBLE database search
Codon Usage Database	Database of Codon usages
SANGER	Portal site for bioinformatics
genbank updata	GenBank Updata information
JSNPs	日本人SNPsDB
シロイヌナズナデータベース	シロイヌナズナゲノムデータベース
HGREP	ヒトゲノム再構築プロジェクト
dbSNP	NCBIのSNPデータベース

リンク

データベース名	概要	関連論文
DatabaseList	ゲノム解析班のデータベースリスト
NAR Database	NARデータベース特集