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philippemichel/quarto_clinique

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Lifecycle: experimental

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Fichiers & dossiers utiles pour une étude clinique simple.

L'idée est de copier (ou cloner) ce dossier & on est prêt à travailler.

Les modèles Quarto ont une page de garde générée par Quarto Title Page. Ils comportent une page generique.tex avec les informations légales (en cours d'écriture) & les noms des divers intervenants. Un glossaire est généré comportant une page pour les acronymes & une page de définitions. La bibliographie est générée avec le format jama.csl, les références sont dans le fichier stat.bib.

Dossiers

Deux dossiers sont créés dont le nom suffit à leur description :

Docs Pour y mettre toute la doc du projet.

datas pour les datas avec un sous dossier réserve qui contient le fichier brut fournit par l'investigateur qu'on ne modifie jamais.

Fichiers

_quarto.xml est le fichier de configuration de Quarto utilisé pour toutes les pages. Il comporte aussi les info de mise en page $\LaTeX$ (police, glossaire, couleur etc.). Vu que ce fichier est sensé me servir en priorité le logo & le code couleur sont ceux de mon hôpital mais c’est facile à modifier.

base.qmd Un fichier Quarto quasi vide pour commencer un nouveau document qui me sert principalement pour des essais.

generique2.tex Le modèle de page pour les noms des intervenants, les infos légales etc.

jama.csl Le style de la bibliographie.

novo_usrc.png Le logo de mon établissement.

plan_analyse.qmd Un squelette (très vide) pour le PAS (Plan d'Analyse Statistique).

rapport_pdf.qmd Un squelette pour un rapport d'analyse statistique d'une étude clinique simple.

stat.bib La bibliographie (format Bib$\LaTeX$)

fragments.qmd Un fichier pour y mettre des bouts de code ou de texte qu'on veut réutiliser. La plupart sont aussi dans mes snippets.

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Packages

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