Skip to content

A shared repository for several exercises pertaining to the "computational drug design" course at UCT Prague

Notifications You must be signed in to change notification settings

lich-uct/cdd2019

Folders and files

NameName
Last commit message
Last commit date

Latest commit

 

History

62 Commits
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Repository files navigation

Sdílený repositář, kde spolu budeme sdílet všechno, co se sdílet dá ohledně CDD neboli počítačového návrhu léčiv

Prvně bude potřeba git, jehož pomocí si tento repozitář můžeme naklonovat:
https://git-scm.com/

Naklonování repozitáře:
    git clone CESTA

Dále se nám bude hodit conda, slouží pro vytvoření vývojového prostředí plus je to i balíčkovací systém pro Python:
https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html

Vytvoření prostředí:
    conda create -n JMÉNO_PROSTŘEDÍ BALÍČKY

pro nás se speciálně hodí (parametr c je pro jiný něž globální kanál):
    conda create -n pnl -c rdkit python=3 rdkit rdkit-postgresql jupyter seaborn scikit-learn

pokud jste na metacentru, tak je problém, že tam není X-server
    conda create -n pnl -c rdkit rdkit-postgresql rdkit cairo nox
    conda activate pnl
    # možná i source activate pnl
    pip install jupyter
    
    lepší řešení se možná se našlo, nainstalujte:
    apt install libxext6 libxrender-dev
    
pokud něco blokuje port můžete se kouknout:
netstat -tulpn

About

A shared repository for several exercises pertaining to the "computational drug design" course at UCT Prague

Resources

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published