LaIW20160427

このページは、2016/04/27に行われた、ライフ&インフォ女子の会の「さらに複雑なグラフの作図、解析結果の共有、記録」の講義資料です

必要なソフトウェアのインストールの仕方

以下のソフトウェアがあらかじめインストールされている必要があります。なお、OSはMac OS Xを想定しています

1. R : 本講義で説明するコードの実行
2. R-Studio : レポート作成
3. Latex環境 : レポートのpdf形式への変換
4. pandoc : レポートの様々な形式への変換

Rは、CRAN Homepageの、Download R for (Mac) OS Xで、R-3.2.4.pkg（2016/4/25時点で最新版）をダウンロードの上、インストールしてください

R-Studioは、R-Studio Homepageの、RStudio 0.99.896 - Mac OS X 10.6+ (64-bit, 2016/4/25時点で最新版）をダウンロードの上、インストールしてください

Latex環境は、MacTex Homepageの、MacTeX.pkg（MacTex 2015, 2016/4/25時点で最新版）をダウンロードの上、インストールしてください

pandocはR-Studioインストール時に、自動的に導入されるとのことですが、もしインストールされていなかった場合は、Macのターミナルを起動後に、homebrewコマンドを以下のように実行してください（2016/4/25時点でバージョンが1.12.4.2）

brew install pandoc

必要なパッケージのインストールの仕方

以下のRパッケージがあらかじめインストールされている必要があります

1. ggplot2 : 作図
2. reshape : ggplot2が想定するデータ形式への変換
3. GGally : ggplot2風のペアプロット
4. pairsD3 : インタラクティブなペアプロット
5. scatterplot3d : 3次元描画
6. animation : 動画作成
7. rgl : インタラクティブな3次元描画
8. plotly : インタラクティブな作図

まず、Rを起動します

R

次に、以下のコードを実行することでパッケージがインストールされます

install.packages("ggplot2")
install.packages("reshape")
install.packages("GGally")
install.packages("pairsD3")
install.packages("scatterplot3d")
install.packages("animation")
install.packages("rgl")
install.packages("plotly")

講義中で利用したスライドについて

ライフ&インフォ女子会.key、またはライフ&インフォ女子会.pdfを参照してください

講義中で利用したコードについて

demo.Rに書かれています。Rのコンソール画面にコピー&ペーストしてご利用ください

講義中で説明したレポートについて

静的なレポート例.Rmd、Irisの個体差.Rmdがそれに相当します。ダブルクリックで、R-Studioが起動するので、KNIT TO HTMLなどのボタンで、各フォーマットに変換してください