EMENTA: O objetivo deste curso é oferecer um treinamento teórico-prático no uso da linguagem de programação R com aplicação na biologia e na conservação da biodiversidade.
No primeiro dia do curso, teremos uma aula teórica sobre o uso do R e sua aplicação biológica utilizando exemplos dentro de três níveis de organização biológica (organismos, populações e comunidades). Também faremos uma introdução rápida ao R, apresentando os principais conceitos.
No segundo dia, teremos uma aula totalmente prática utilizando o RStudio Cloud, uma versão online que dispensa a instalação do R no computador. O objetivo desta aula será construir uma rede de interações tróficas predador-presa. Conheceremos alguns pacotes básicos do R para a visualização gráfica de redes tróficas e mutualísticas. Aprenderemos a construir matrizes de dados simétrica e assimétrica. Estudaremos alguns parâmetros estatísticos e matemáticos como o grau de conectância e as interações possíveis, a distância e a centralidade, a modularidade e o aninhamento, entre outros. Faremos a interpretação dos resultados gerados pelas análises e discutiremos as suas aplicações biológicas.
Não é necessário ter conhecimento prévio de R ou estatística.
PÚBLICO-ALVO: Estudantes de graduação, pós-graduação e profissionais interessados em redes ecológicas.
MATERIAIS:
EXERCÍCIO: O objetivo da nossa aula prática é construir esse gráfico 3D que representa a rede de interações ecológica da onça-pintada (Panthera onca) com dados de literatura compilados por Palmeira 2015.
Instale o pacote 'foodweb' do R:
# install.packages("foodweb")
library(foodweb)REFERÊNCIAS:
Palmeira FBL, 2015. Coocorrência, interações tróficas e distribuição potencial da onça-pintada (Panthera onca) no bioma Amazônia. Tese de Doutorado, Universidade de São Paulo (USP).
Perdomo G, 2012. Package 'foodweb'.