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Manuale di Documentazione

0. Età

Per evitare l'insorgere di problemi di privacy legati al livello di dettaglio abbiamo definito la seguente classificazione d'età ridotta: {[0,39],[40,59],[60,69],[70,79],[80+]}.

1. Sintomi

Riconosciuta la complessità dei dati relativi ai casi sintomatici (molteplice data di insorgenza dei sintomi, talvolta riportati prima e dopo la data di esito positivo del test diagnostico) abbiamo dovuto definire degli intervalli di plausibilità notevoli al fine di:

1. tenere conto della variabilità indotta da ritardi strutturali del fenomeno sottostante come il periodo di incubazione (McAloon et al. (2020));
2. sondare la variabilità indotta da ritardi contingenti dovuti all'eterogeneità dei dispositivi diagnostici (i.p. diverso limit of detection) utilizzati come il periodo di positività (Larremore et al. (2020), Tom, Mina (2020), Cevik et al. (2020), Mallet et al. (2020), Cleary et al. (2021), Boum et al. (2021), Hellewell et al. (2021), Kissler et al. (2021));
3. quantificare l'incertezza indotta dalla scelta di un particolare intervallo o soglia;
4. stimare con maggior accuratezza e robustezza l'incidenza di infezioni latenti nel periodo precedente alla conferma del primo caso positivo in modo da poter fissare le condizioni iniziali dei modelli compartimentali.

Abbiamo quindi definito i seguenti tre intervalli di plausibilità notevoli complementari:

• [data_positività - 30, data_positività + 14] ;
• [data_positività - 20, data_positività + 14] ;
• [data_positività - 10, data_positività + 14] .

Pertanto l'algoritmo che definisce univocamente l'effettiva data di insorgenza sintomi di un paziente funziona come segue:

1. Impostare un intervallo di plausibilità;
2. Considerare come effettiva data di insorgenza sintomi quella più prossima al limite inferiore dell'intervallo di plausibilità adottato in modo che ci sia un'unica data di insorgenza sintomi valida per ogni paziente.

2. Ricoveri

Definiamo:

• Reparto: periodo di residenza in un reparto ospedaliero (di tipo ordinario, intensivo oppure riabilitativo) delimitato dagli eventi notevoli data_ammissione e data_dimissione;
• Ricovero: successione di periodi di residenza in reparti ospedalieri visitati da un paziente.

In particolare:

• AO = ammissione_ordinaria : ammissione in reparto ordinario ;
• DO = dimissione_ordinaria: dimissione da reparto ordinario ;
• AI = ammissione_intensiva : ammissione in reparto intensivo ;
• DI = dimissione_intensiva: dimissione da reparto intensivo ;
• AR = ammissione_riabilitativa : ammissione in reparto riabilitativo ;
• DR = dimissione_riabilitativa: dimissione da reparto riabilitativo .

2.1 Ricoveri pre-tampone positivo

Per ciò che concerne tutti i pazienti che possiedono data_ammissione_x (con x = ordinaria o x = intensiva) precedente alla data_positività si procede impostando data_positività = data_ammissione_x .

2.2 Ricoveri post-fine percorso

Trascurare i ricoveri avvenuti dopo la data_fine_percorso.

2.3 Reparti pre-positività

Rimuovere i reparti che avvengono interamente prima della data_positività o la cui data_dimissione coincide con la data_positività.

2.4 Giustapposizione e uniformizzazione reparti

SE due reparti successivi sono dello stesso tipo allora i due reparti saranno sostituiti da un reparto che avrà come data_ammissione la data_ammissione del primo e come data_dimissione la data_dimissione del secondo;

ALTRIMENTI SE due reparti successivi sono di tipo diverso ma la data_ammissione del secondo non coincide con la data_dimissione del primo, allora si porterà la data_dimissione del primo alla data_ammissione del secondo.

3. Quarantene

Definiamo quarantena un generico periodo di isolamento imposto ad un qualunque soggetto (sia questo un caso sospetto o un caso confermato) completamente specificato da una data_inizio_quarantena ed una data_fine_quarantena.

• Quarantena precauzionale: un periodo di isolamento imposto ad un caso sospetto completamente specificato da una data_inizio_quarantena_precauzionale e una data_fine_quarantena_precauzionale tale che data_fine_quarantena_precauzionale <= data_positività;
• Quarantena ordinaria: un periodo di isolamento imposto ad un caso confermato completamente specificato da una data_inizio_quarantena_ordinaria e una data_fine_quarantena_ordinaria tale che data_inizio_quarantena_ordinaria = data_positività.

3.1 Periodo di isolamento o quarantena

Dalla lettura di tutte le ordinanze, i comunicati e le circolari emanati dal Ministero della Salute ed estratto tutti quelli rilevanti per informare la scelta degli estremi di tali intervalli (i.e. che presentassero il numero di giorni di isolamento imposti a casi sospetti o confermati):

1. Ordinanza del 21-02-2020 ;
2. Ordinanza del 28-03-2020;
3. Ordinanza del 23-12-2020;
4. Circolare del 28-02-2020;
5. Circolare del 29-05-2020;
6. Circolare del 12-10-2020.

si evince che in Italia durante l'anno 2020 (periodo di interesse per cui sono disponibili i dati stratificati per età e stato clinico) sono stati applicate tre differenti durate del periodo di isolamento o quarantena:

• T_quarantena = |data_fine_quarantena - data_inizio_quarantena| = 14 giorni dal 21-02-2020 al 12-10-2020 ;
• T_quarantena = |data_fine_quarantena - data_inizio_quarantena| = 10 giorni con test per gli asintomatici dal 12-10-2020 ;
• T_quarantena = |data_fine_quarantena - data_inizio_quarantena| = 10 giorni di cui almeno 3 giorni senza sintomi con test per i sintomatici dal 12-10-2020 ;
• T_quarantena = |data_fine_quarantena - data_inizio_quarantena| = 21 giorni dall'insorgenza dei sintomi per i sintomatici dal 12-10-2020 ;
• T_quarantena = |data_fine_quarantena - data_inizio_quarantena| = 10 giorni con test dall'ultima esposizione al caso confermato positivo per i contatti stretti di casi confermati positivi dal 12-10-2020;
• T_quarantena = |data_fine_quarantena - data_inizio_quarantena| = 14 giorni senza test dall'ultima esposizione al caso confermato positivo per i contatti stretti di casi confermati positivi dal 12-10-2020.

In Piemonte è stato adottato un algoritmo prescrittivo di quarantena ed isolamento documentato in Milani et al. (2021) per tutto l'anno 2020 (periodo di interesse per cui sono disponibili i dati stratificati per età e stato clinico).

3.2 Algoritmo di identificazione date effettive di quarantena

Per ciò che concerne l'effettiva data di fine di quarantena di un paziente si procede come segue:

1. SE il paziente possiede data_fine_quarantena ALLORA data_fine_quarantena_ordinaria = data_fine_quarantena ;
2. SE il paziente NON possiede data_fine_quarantena E possiede data_guarigione o data_conclusione_percorso (ASL, SISP) ALLORA data_fine_quarantena_ordinaria = data_guarigione o data_fine_quarantena_ordinaria = data_conclusione_percorso ;
3. SE il paziente NON possiede data_fine_quarantena E NON possiede data_guarigione o data_conclusione_percorso(ASL, SISP) E possiede data_ultimo_negativo ALLORA data_fine_quarantena_ordinaria = data_ultimo_negativo
4. SE il paziente NON possiede data_fine_quarantena E NON possiede data_guarigione o data_conclusione_percorso (ASL, SISP) E NON possiede data_ultimo_negativo ALLORA data_fine_quarantena_ordinaria = data_inizio_quarantena_ordinaria + T_quarantena (per i dettagli si veda la descrizione dell'algoritmo riportata di seguito).

In generale definiamo:

• T_quarantena = 14 giorni ;
• {data_inizio_quarantena_i}: l'insieme delle data_inizio_quarantena di un paziente ;
• {data_inizio_quarantena_i < data_positività}: l'insieme delle data_inizio_quarantena precedenti alla data_positività ;
• {data_positività, {data_inizio_quarantena_i}}: l'insieme che contiene sia le data_inizio_quarantena sia la data_positività ;
• {selected_data_inizio_quarantena_i}: l'insieme delle data_inizio_quarantena di un paziente i cui elementi sono:
  • selected_data_inizio_quarantena_1 = data_inizio_quarantena_1 ;
  • selected_data_inizio_quarantena_2 = min({data_inizio_quarantena_i > data_inizio_quarantena_1 + T_quarantena });
  • selected_data_inizio_quarantena_3 = min({data_inizio_quarantena_i > selected_data_inizio_quarantena_2 + T_quarantena }) ;
  • ... ;
  • selected_data_inizio_quarantena_i = min({data_inizio_quarantena_i > selected_data_inizio_quarantena_(i-1) + T_quarantena }) ;
  • ... ;
• {data_fine_quarantena_i}: l'insieme delle data_fine_quarantena di un paziente;
• data_ammissione_x: una generica data di ammissione in reparto ospedaliero con x IN {ordinaria, intensiva, riabilitativa};
• data_dimissione_x: una generica data di dimissione da reparto ospedaliero con x IN {ordinaria, intensiva, riabilitativa};
• {data_ammissione_x_i}: l'insieme delle data_ammissione_x di un paziente;
• {data_dimissione_x_i}: l'insieme delle data_dimissione_x di un paziente.

L' algoritmo che si occupa di assegnare le date effettive di inizio e fine quarantena ordinaria e precauzionale a ciascun paziente funziona come segue:

1. Se non presenta data_ammissione_ordinaria E non presenta data_ammissione_intensiva :

   • data_inizio_quarantena_precauzionale = max({selected_data_inizio_quarantena_i < data_positività}) ;

   • SE presenta data_fine_quarantena E si è assegnata data_inizio_quarantena_precauzionale, ALLORA data_fine_quarantena_precauzionale = min({data_positività, max({data_inizio_quarantena_precauzionale < data_fine_quarantena_i <= data_positività}) }) ;

   • ALTRIMENTI SE non presenta data_fine_quarantena E si è assegnata data_inizio_quarantena_precauzionale, ALLORA data_fine_quarantena_precauzionale = min({data_positività, data_inizio_quarantena_precauzionale + T_quarantena}) ;

   • ALTRIMENTI SE non presenta data_fine_quarantena E non si è assegnata data_inizio_quarantena_precauzionale, ALLORA non si assegnerà data_fine_quarantena_precauzionale ;

   • data_inizio_quarantena_ordinaria = data_positività ;

   • SE presenta data_guarigione (oppure data_decesso) allora si procede come segue:

     • SE la data_guarigione (oppure data_decesso) dista dalla data_positività MENO del multiplo di 7 giorni più vicino all'upper whisker della distribuzione di tempo di transizione P_G (oppure P_D) allora data_fine_quarantena_ordinaria = data_guarigione (oppure data_fine_quarantena_ordinaria = data_decesso);
     • ALTRIMENTI SE la data_guarigione (oppure data_decesso) dista dalla data_positività PIU' del multiplo di 7 giorni più vicino all'upper whisker della distribuzione di tempo di transizioneP_G (oppure P_D) E vi è almeno una data_fine_quarantena allora data_fine_quarantena_ordinaria = max(data_positività < data_fine_quarantena_i < data_positività + P_G_upper_whisker) (oppure data_fine_quarantena allora data_fine_quarantena_ordinaria = max(data_positività < data_fine_quarantena_i < data_positività + P_D_upper_whisker));
     • ALTRIMENTI SE la data_guarigione (oppure data_decesso) dista dalla data_positività PIU' del multiplo di 7 giorni più vicino all'upper whisker della distribuzione di tempo di transizione P_G (oppure P_D) E NON vi è alcuna una data_fine_quarantena allora data_fine_quarantena_ordinaria = data_positività + P_G_upper_whisker (oppure data_fine_quarantena_ordinaria = data_positività + P_D_upper_whisker).

   • ALTRIMENTI SE NON presenta data_guarigione (oppure data_decesso) allora si procede come segue:

     • SE vi è almeno una data_fine_quarantena ALLORA data_fine_quarantena_ordinaria = max(data_positività < data_fine_quarantena_i < data_positività + P_G_upper_whisker);
     • ALTRIMENTI SE NON vi è alcuna una data_fine_quarantena allora data_fine_quarantena_ordinaria = data_positività + P_G_upper_whisker.

2. SE presenta data_ammissione_ordinaria O presenta data_ammissione_intensiva :

   • data_inizio_quarantena_precauzionale = max({selected_data_inizio_quarantena_i < data_positività}) ;

   • data_fine_quarantena_precauzionale = min( {data_positività, max({ data_inizio_quarantena_precauzionale < data_fine_quarantena_i <= data_positività})} ) ;

   • SE presenta data_fine_quarantena E max({data_fine_quarantena_i}) <= max({data_dimissione_x_i}):

     • SE data_positività = min({data_ammissione_x_i}) ALLORA non si assegneranno le date di quarantena_ordinaria ;
     • SE min({data_ammissione_x_i}) > data_positività:
       • data_inizio_quarantena_ordinaria = data_positività ;
       • data_fine_quarantena_ordinaria = min({data_ammissione_x_i}) .
     • Non consideriamo il caso in cui data_positività > min({data_ammissione_x_i}) in quanto questa eventualità è esclusa dal punto 2.1.

   • ALTRIMENTI SE presenta data_fine_quarantena E max({data_fine_quarantena_i}) > max({data_dimissione_x_i}):

     • SE min({data_ammissione_x_i}) = data_positività, ALLORA non si assegneranno le date di quarantena_ordinaria;

     • ALTRIMENTI SE min({data_ammissione_x_i}) > data_positività:

       • data_inizio_quarantena_ordinaria = data_positività ;
       • data_fine_quarantena_ordinaria = min({date_ammissione_x}) .

     • Non consideriamo il caso in cui data_positività > min({data_ammissione_x_i}) in quanto questa eventualità è esclusa dal punto 2.1.

   • ALTRIMENTI SE non presenta data_fine_quarantena:

     • SE min({data_ammissione_x_i}) = data_positività, ALLORA non si assegneranno le date di quarantena_ordinaria;

     • SE min({data_ammissione_x_i}) > data_positività:

       • data_inizio_quarantena_ordinaria = data_positività;
       • data_fine_quarantena_ordinaria = min({date_ammissione_x_i}).

     • Non consideriamo il caso in cui data_positività > min({data_ammissione_x_i}) in quanto questa eventualità è esclusa dal punto 2.1.

4. Guarigioni e Decessi

SE NON presenta alcuna data_ammissione_x allora si procede come segue:

• SE presenta data_guarigione (oppure data_decesso) E data_guarigione > data_fine_quarantena_ordinaria (oppure data_decesso > data_fine_quarantena_ordinaria) ALLORA si correggerà data_guarigione = data_fine_quarantena_ordinaria (oppure data_decesso = data_fine_quarantena_ordinaria);
• ALTRIMENTI SE NON presenta data_guarigione né data_decesso, ALLORA si porrà data_guarigione = data_fine_quarantena_ordinaria.

ALTRIMENTI SE presenta almeno una data_ammissione_x, si procede come segue:

• SE presenta data_guarigione (oppure data_decesso) E data_guarigione != max({data_dimissione_x_i}) (oppure data_decesso != max({data_dimissione_x_i})) ALLORA si correggerà data_guarigione = max({data_dimissione_x_i}) (oppure data_decesso = max({data_dimissione_x_i}));
• ALTRIMENTI SE NON presenta data_guarigione né data_decesso, ALLORA si porrà data_guarigione = max({data_dimissione_x_i}).

5. Sequenze

Definiamo sequenza o percorso clinico la successione ordinata degli eventi notevoli:

• IQP = inizio_quarantena_precauzionale: inizio della quarantena precauzionale ;
• FQP = fine_quarantena_precauzionale: fine della quarantena precauzionale ;
• IQO = inizio_quarantena_ordinaria : inizio della quarantena ordinaria ;
• IS = inizio_sintomi : insorgenza dei sintomi;
• P = positività : conferma dell'esito positivo del tampone analizzato;
• AO = ammissione_ordinaria : ammissione in ricovero ordinario ;
• DO = dimissione_ordinaria: dimissione da ricovero ordinario ;
• AI = ammissione_intensiva : ammissione in ricovero intensivo ;
• DI = dimissione_intensiva: dimissione da ricovero intensivo ;
• AR = ammissione_riabilitativa : ammissione in ricovero riabilitativo ;
• DR = dimissione_riabilitativa: dimissione da ricovero riabilitativo ;
• G = guarigione ;
• D = decesso

che si verificano nelle date notevoli:

• data_IQP = data_inizio_quarantena_precauzionale ;
• data_FQP = data_fine_quarantena_precauzionale ;
• data_IQO = data_inizio_quarantena_ordinaria ;
• data_IS = data_inizio_sintomi ;
• data_P = data_positività ; 
• data_AO = data_ammissione_ordinaria ;
• data_DO = data_dimissione_ordinaria ;
• data_AI = data_ammissione_intensiva ;
• data_DI = data_dimissione_intensiva ;
• data_AR = data_ammissione_riabilitativa ;
• data_DR = data_dimissione_riabilitativa ;
• data_G = data_guarigione ;
• data_D = data_decesso .

Di seguito ci occupiamo di:

1. descrivere l'algoritmo che genera le serie temporali stratificate per età e stato clinico relative alle sequenze presenti nel line-list database gestito dal CSI Piemonte;
2. riportare un insieme comprensivo ma potenzialmente incompleto di sequenze da considerare (utile per effettuare dei check) .

5.1 Algoritmo

1. Ciascun paziente ha una propria sequenza ordinata di eventi (ad esempio (IQP,FQP,IQO,IS,P,G)) che si sono verificati in una sequenza ordinata di date (in questo esempio(data_IQP, data_FQP, data_IQO, data_IS, data_P, data_G)).
2. Per ogni data (ad esempio data_IQO=10/03/2020) nella sequenza ordinata di eventi (ad esempio (IQP,FQP,IQO,IS,P,G)) si va ad aggiungere un'osservazione alla riga corrispondente alla data (qui data=data_IQO) e alla colonna relativa all'evento per il percorso specifico (qui colonna iqp_fqp_IQO_is_p_g: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di inizio quarantena ordinaria della coorte con percorso (IQP,FQP,IQO,IS,P,G)).

Evitiamo di riportare anche le rappresentazioni dei datasets di esempio troncati, ovvero privi delle colonne relative a tutte le possibili permutazioni rilevanti, perché si tratterebbe di un semplice passaggio da 4 a 13 eventi notevoli rispetto a quello riportato nell'allegato precedente.

5.2 Insieme di possibili sequenze

Riportiamo qui di seguito un insieme comprensivo (ma potenzialmente incompleto) di percorsi ordinati da prendere in considerazione (i.e. sia quelli che includono sia quelli che escludono la quarantena ordinaria e/o precauzionale, sia quelli che includono sia quelli che escludono l'insorgenza dei sintomi, sia quelli che includono sia quelli che escludono i ricoveri ordinari e/o intensivi e/o riabilitativi). La suddivisione in casi notevoli di questi ultimi è stata concepita per pura comodità e chiarezza espositiva, dunque senza riflettere alcuna richiesta o definizione (e.g. la presenza o meno di flag di sintomaticità per restringere il campione dei pazienti con un certo percorso plausibile).

Casi Asintomatici

• (IQO,P,G) = (inizio_quarantena_ordinaria, positività, guarigione) : percorso plausibile per casi asintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IQO,G) = (positività, inizio_quarantena_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per casi asintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,P,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, guarigione) : percorso plausibile per casi asintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IQO,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per casi asintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;

Casi Sintomatici, Non Ricoverati e Guariti

• (IS,IQO,P,G) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,IS,P,G) = (inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,P,IS,G) = (inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,P,IQO,G) = (inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IS,IQO,G) = (positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IQO,IS,G) = (positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,IQO,P,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,IQO,P,G) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,IS,P,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,P,IS,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,P,IQO,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,P,IQO,G) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IS,IQO,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IQO,IS,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;

Casi Sintomatici, Non Ricoverati e Deceduti

• (IS,IQO,P,D) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,IS,P,D) = (inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,P,IS,D) = (inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,P,IQO,D) = (inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IS,IQO,D) = (positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IQO,IS,D) = (positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,IQO,P,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,IQO,P,D) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,IS,P,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,P,IS,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,P,IQO,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,P,IQO,D) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IS,IQO,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IQO,IS,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;

Casi Sintomatici, Ricoverati Ordinari e Guariti

• (IS,IQO,P,AO,DO,G) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,IS,P,AO,DO,G) = (inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,P,IS,AO,DO,G) = (inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,P,IQO,AO,DO,G) = (inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IS,IQO,AO,DO,G) = (positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IQO,IS,AO,DO,G) = (positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,IQO,P,AO,DO,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,IQO,P,AO,DO,G) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,IS,P,AO,DO,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,P,IS,AO,DO,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,P,IQO,AO,DO,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,P,IQO,AO,DO,G) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IS,IQO,AO,DO,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;

Casi Sintomatici, Ricoverati Ordinari e Deceduti

• (IS,IQO,P,AO,DO,D) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,IS,P,AO,DO,D) = (inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,P,IS,AO,DO,D) = (inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,P,IQO,AO,DO,D) = (inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IS,IQO,AO,DO,D) = (positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IQO,IS,AO,DO,D) = (positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,IQO,P,AO,DO,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,IQO,P,AO,DO,D) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,IS,P,AO,DO,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,P,IS,AO,DO,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,P,IQO,AO,DO,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,P,IQO,AO,DO,D) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IS,IQO,AO,DO,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;

Casi Sintomatici, Ricoverati Intensivi e Guariti

• (IS,IQO,P,AI,DI,G) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,IS,P,AI,DI,G) = (inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,P,IS,AI,DI,G) = (inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,P,IQO,AI,DI,G) = (inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IS,IQO,AI,DI,G) = (positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IQO,IS,AI,DI,G) = (positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,IQO,P,AI,DI,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,IQO,P,AI,DI,G) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,IS,P,AI,DI,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,P,IS,AI,DI,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,P,IQO,AI,DI,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,P,IQO,AI,DI,G) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IS,IQO,AI,DI,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IQO,IS,AI,DI,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;

Casi Sintomatici, Ricoverati Intensivi e Deceduti

• (IS,IQO,P,AI,DI,D) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,IS,P,AI,DI,D) = (inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,P,IS,AI,DI,D) = (inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,P,IQO,AI,DI,D) = (inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IS,IQO,AI,DI,D) = (positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IQO,IS,AI,DI,D) = (positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,IQO,P,AI,DI,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,IQO,P,AI,DI,D) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,IS,P,AI,DI,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,P,IS,AI,DI,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,P,IQO,AI,DI,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,P,IQO,AI,DI,D) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IS,IQO,AI,DI,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IQO,IS,AI,DI,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;

Casi Sintomatici, Ricoverati Ordinari-Intensivi e Guariti

• (IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,G) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,IS,P,AO,DO,AI,DI,G) = (inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,P,IS,AO,DO,AI,DI,G) = (inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,P,IQO,AO,DO,AI,DI,G) = (inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IS,IQO,AO,DO,AI,DI,G) = (positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,G) = (positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,IQO,P,AO,DO,AI,DI,G) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,IS,P,AO,DO,AI,DI,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,P,IS,AO,DO,AI,DI,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,P,IQO,AO,DO,AI,DI,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,P,IQO,AO,DO,AI,DI,G) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IS,IQO,AO,DO,AI,DI,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;

Casi Sintomatici, Ricoverati Ordinari-Intensivi e Deceduti

• (IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,D) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,IS,P,AO,DO,AI,DI,D) = (inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,P,IS,AO,DO,AI,DI,D) = (inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,P,IQO,AO,DO,AI,DI,D) = (inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IS,IQO,AO,DO,AI,DI,D) = (positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,D) = (positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,IQO,P,AO,DO,AI,DI,D) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,IS,P,AO,DO,AI,DI,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,P,IS,AO,DO,AI,DI,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,P,IQO,AO,DO,AI,DI,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,P,IQO,AO,DO,AI,DI,D) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IS,IQO,AO,DO,AI,DI,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;

Casi Sintomatici, Ricoverati Ordinari-Intensivi-Riabilitativi e Guariti

• (IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,G) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,IS,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,G) = (inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,P,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,G) = (inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,P,IQO,AO,DO,AI,DI,AR,DR,G) = (inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IS,IQO,AO,DO,AI,DI,AR,DR,G) = (positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,G) = (positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, guarigione) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,IQO,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,G) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,IS,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,P,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,P,IQO,AO,DO,AI,DI,AR,DR,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,P,IQO,AO,DO,AI,DI,AR,DR,G) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IS,IQO,AO,DO,AI,DI,AR,DR,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,G) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, guarigione) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;

Casi Sintomatici, Ricoverati Ordinari-Intensivi-Riabilitativi e Deceduti

• (IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,IS,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) = (inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQO,P,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) = (inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,P,IQO,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) = (inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IS,IQO,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) = (positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) = (positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, decesso) : percorso plausibile per casi sintomatici a cui non è mai stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,IQO,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,IS,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, positività, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IQO,P,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_quarantena_ordinaria, positività, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,IS,P,IQO,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, inizio_sintomi, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IS,IQP,FQP,P,IQO,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) = (inizio_sintomi, inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IS,IQO,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_sintomi, inizio_quarantena_ordinaria, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;
• (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) = (inizio_quarantena_precauzionale, fine_quarantena_precauzionale, positività, inizio_quarantena_ordinaria, inizio_sintomi, ammissione_ordinaria, dimissione_ordinaria, ammissione_intensiva, dimissione_intensiva, ammissione_riabilitativa, dimissione_riabilitativa, decesso) : percorso plausibile per sintomatici a cui è stata imposta la quarantena precauzionale;

Dunque le variabili o colonne del dataset finale (di cui riporteremo solo una porzione notevole) saranno:

• data: data relativa al giorno di calendario ;
• età: classe di età;
• stato_clinico: stato clinico appartenente all'insieme {"SINTOMATICO", "ASINTOMATICO"};
• IQO_p_g: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi asintomatici per data di inizio quarantena ordinaria della coorte con percorso (IQO,P,G) ;
• iqo_P_g: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi asintomatici per data di positività della coorte con percorso (IQO,P,G) ;
• iqo_p_G: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi asintomatici per data di guarigione della coorte con percorso (IQO,P,G) ;
• ...
• IS_iqo_p_g: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di inizio sintomi della coorte con percorso (IS,IQO,P,G) ;
• is_IQO_p_g: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di inizio quarantena ordinaria della coorte con percorso (IS,IQO,P,G) ;
• is_iqo_P_g: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di positività della coorte con percorso (IS,IQO,P,G) ;
• is_iqo_p_G: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di guarigione della coorte con percorso (IS,IQO,P,G) ;
• ...
• IS_iqo_p_ao_do_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di inizio sintomi della coorte con percorso (IS,IQO,P,AO,DO,D) ;
• is_IQO_p_ao_do_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di inizio quarantena ordinaria della coorte con percorso (IS,IQO,P,AO,DO,D) ;
• is_iqo_P_ao_do_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di positività della coorte con percorso (IS,IQO,P,AO,DO,D) ;
• is_iqo_p_AO_do_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di ammissione ordinaria della coorte con percorso (IS,IQO,P,AO,DO,D) ;
• is_iqo_p_ao_DO_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di dimissione ordinaria della coorte con percorso (IS,IQO,P,AO,DO,D) ;
• is_iqo_p_ao_do_D: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di decesso della coorte con percorso (IS,IQO,P,AO,DO,D) ;
• ...
• IS_iqo_p_ao_do_ai_di_ar_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di inizio sintomi della coorte con percorso (IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• is_IQO_p_ao_do_ai_di_ar_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di inizio quarantena ordinaria della coorte con percorso (IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• is_iqo_P_ao_do_ai_di_ar_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di positività della coorte con percorso (IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• is_iqo_p_AO_do_ai_di_ar_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di ammissione ordinaria della coorte con percorso (IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• is_iqo_p_ao_DO_ai_di_ar_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di dimissione ordinaria della coorte con percorso (IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• is_iqo_p_ao_do_AI_di_ar_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di ammissione intensiva della coorte con percorso (IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• is_iqo_p_ao_do_ai_DI_ar_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di dimissione intensiva della coorte con percorso (IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• is_iqo_p_ao_do_ai_di_AR_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di ammissione riabilitativa della coorte con percorso (IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• is_iqo_p_ao_do_ai_di_ar_DR_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di dimissione riabilitativa della coorte con percorso (IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• is_iqo_p_ao_do_ai_di_ar_dr_D: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di decesso della coorte con percorso (IS,IQO,P,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• ...
• IQP_fqp_p_iqo_is_ao_do_ai_di_ar_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di inizio quarantena precauzionale della coorte con percorso (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• iqp_FQP_p_iqo_is_ao_do_ai_di_ar_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di fine quarantena precauzionale della coorte con percorso (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• iqp_fqp_P_iqo_is_ao_do_ai_di_ar_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di positività della coorte con percorso (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• iqp_fqp_p_IQO_is_ao_do_ai_di_ar_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di inizio quarantena ordinaria della coorte con percorso (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• iqp_fqp_p_iqo_IS_ao_do_ai_di_ar_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di inizio sintomi della coorte con percorso (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• iqp_fqp_p_iqo_is_AO_do_ai_di_ar_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di ammissione ordinaria della coorte con percorso (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• iqp_fqp_p_iqo_is_ao_DO_ai_di_ar_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di dimissione ordinaria della coorte con percorso (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• iqp_fqp_p_iqo_is_ao_do_AI_di_ar_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di ammissione intensiva della coorte con percorso (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• iqp_fqp_p_iqo_is_ao_do_ai_DI_ar_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di dimissione intensiva della coorte con percorso (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• iqp_fqp_p_iqo_is_ao_do_ai_di_AR_dr_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di ammissione riabilitativa della coorte con percorso (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• iqp_fqp_p_iqo_is_ao_do_ai_di_ar_DR_d: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di dimissione riabilitativa della coorte con percorso (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;
• iqp_fqp_p_iqo_is_ao_do_ai_di_ar_dr_D: serie temporale stratificata per età e stato clinico dei casi sintomatici per data di decesso della coorte con percorso (IQP,FQP,P,IQO,IS,AO,DO,AI,DI,AR,DR,D) ;

6. Tempi di Transizione

Definiamo tempi di transizione gli intervalli temporali intercorsi tra eventi notevoli:

• T_IQP_FQP: intervallo di tempo intercorso tra inizio_quarantena_precauzionale e fine_quarantena_precauzionale ;
• T_FQP_IS: intervallo di tempo intercorso tra fine_quarantena_precauzionale e inizio_sintomi ;
• T_FQP_P: intervallo di tempo intercorso tra fine_quarantena_precauzionale e positività ;
• T_FQP_IQO: intervallo di tempo intercorso tra fine_quarantena_precauzionale e inizio_quarantena_ordinaria ;
• T_IS_P: intervallo di tempo intercorso tra inizio_sintomi e positività ;
• T_IS_IQO: intervallo di tempo intercorso tra inizio_sintomi e inizio_quarantena_ordinaria ;
• T_IS_AO: intervallo di tempo intercorso tra inizio_sintomi e ammissione_ordinaria ;
• T_IS_AI: intervallo di tempo intercorso tra inizio_sintomi e ammissione_intensiva ;
• T_IS_G: intervallo di tempo intercorso tra inizio_sintomi e guarigione ;
• T_IS_D: intervallo di tempo intercorso tra inizio_sintomi e decesso ;
• T_P_IS: intervallo di tempo intercorso tra positività e inizio_sintomi ;
• T_P_IQO: intervallo di tempo intercorso tra positività e inizio_quarantena_ordinaria ;
• T_P_AO: intervallo di tempo intercorso tra positività e ammissione_ordinaria ;
• T_P_AI: intervallo di tempo intercorso tra positività e ammissione_intensiva ;
• T_P_G: intervallo di tempo intercorso tra positività e guarigione ;
• T_P_D: intervallo di tempo intercorso tra positività e decesso ;
• T_IQO_P: intervallo di tempo intercorso tra inizio_quarantena_ordinaria e positività ;
• T_IQO_IS: intervallo di tempo intercorso tra inizio_quarantena_ordinaria e inizio_sintomi ;
• T_IQO_AO: intervallo di tempo intercorso tra inizio_quarantena_ordinaria e ammissione_ordinaria ;
• T_IQO_AI: intervallo di tempo intercorso tra inizio_quarantena_ordinaria e ammissione_intensiva ;
• T_IQO_G: intervallo di tempo intercorso tra inizio_quarantena_ordinaria e guarigione ;
• T_IQO_D: intervallo di tempo intercorso tra inizio_quarantena_ordinaria e decesso ;
• T_AO_DO: intervallo di tempo intercorso tra ammissione_ordinaria e dimissione_ordinaria ;
• T_AO_AI: intervallo di tempo intercorso tra ammissione_ordinaria e ammissione_intensiva ;
• T_AO_G: intervallo di tempo intercorso tra ammissione_ordinaria e guarigione ;
• T_AO_D: intervallo di tempo intercorso tra ammissione_ordinaria e decesso ;
• T_DO_AI: intervallo di tempo intercorso tra dimissione_ordinaria e ammissione_intensiva ;
• T_DO_G: intervallo di tempo intercorso tra dimissione_ordinaria e guarigione ;
• T_DO_D: intervallo di tempo intercorso tra dimissione_ordinaria e decesso ;
• T_AI_DI: intervallo di tempo intercorso tra ammissione_intensiva e dimissione_intensiva ;
• T_AI_AR: intervallo di tempo intercorso tra ammissione_intensiva e ammissione_riabilitativa ;
• T_AI_G: intervallo di tempo intercorso tra ammissione_intensiva e guarigione ;
• T_AI_D: intervallo di tempo intercorso tra ammissione_intensiva e decesso ;
• T_DI_AR: intervallo di tempo intercorso tra dimissione_intensiva e ammissione_riabilitativa ;
• T_DI_G: intervallo di tempo intercorso tra dimissione_intensiva e guarigione ;
• T_DI_D: intervallo di tempo intercorso tra dimissione_intensiva e decesso ;
• T_AR_DR: intervallo di tempo intercorso tra ammissione_riabilitativa e dimissione_riabilitativa ;
• T_AR_G: intervallo di tempo intercorso tra ammissione_riabilitativa e guarigione ;
• T_AR_D: intervallo di tempo intercorso tra ammissione_riabilitativa e decesso ;
• T_DR_G: intervallo di tempo intercorso tra dimissione_riabilitativa e guarigione ;
• T_DR_D: intervallo di tempo intercorso tra dimissione_riabilitativa e decesso ;

Il dataset in output sarà costituito da più tabelle, ciascuna riportante la distribuzione empirica di un tempo di transizione specifico per una classe d'età, uno stato clinico e temporalmente, con ampiezza dell'intervallo che sarà indicata con T, con binning giornaliero. Per ogni tupla (T_A_B, classe_età, stato_clinico), la procedura è la seguente:

1. Considerare una tupla (T_A_B, classe_età, stato_clinico), porre il periodo di aggregazione temporale T a T = 0 giorni ;
2. Aumentare T di 1 giorno ;
3. Calcolare le distribuzioni empiriche di tempi di transizione relative a ogni intervallo di ampiezza T in cui il dataset viene suddiviso ;
4. Se non vi sono più NA dovuti alla privacy, salvare il dataset, passare alla prossima tupla e quindi tornare al punto 1. ;
5. Se ancora vi sono NA dovuti alla privacy, salvare il dataset e tornare al punto 2. .

Al fine di chiarire ulteriormente il funzionamento dell'algoritmo descritto sopra forniamo un esempio applicativo semplificato qui di seguito:

6.1 Dataset di Date Notevoli in INPUT (TRONCATO)

id	età	stato_clinico	data_IQP	data_FQP	data_IQO	data_IS	data_P
1	73	SINTOMATICO	NA	NA	01-03-2020	02-03-2020	03-03-2020
2	75	SINTOMATICO	NA	NA	02-03-2020	03-03-2020	06-03-2020
3	78	SINTOMATICO	NA	NA	01-03-2020	02-03-2020	03-03-2020
4	71	SINTOMATICO	NA	NA	01-03-2020	02-03-2020	04-03-2020
5	70	SINTOMATICO	NA	NA	02-03-2020	02-03-2020	04-03-2020
6	79	SINTOMATICO	NA	NA	01-03-2020	02-03-2020	04-03-2020
7	77	SINTOMATICO	NA	NA	01-03-2020	02-03-2020	05-03-2020
8	78	SINTOMATICO	NA	NA	02-03-2020	02-03-2020	05-03-2020
9	73	SINTOMATICO	NA	NA	01-03-2020	02-03-2020	05-03-2020
10	71	SINTOMATICO	NA	NA	01-03-2020	02-03-2020	04-03-2020
11	78	SINTOMATICO	NA	NA	01-03-2020	02-03-2020	03-03-2020
12	74	SINTOMATICO	NA	NA	02-03-2020	02-03-2020	06-03-2020
13	72	SINTOMATICO	NA	NA	02-03-2020	02-03-2020	06-03-2020
14	70	SINTOMATICO	NA	NA	01-03-2020	02-03-2020	03-03-2020

6.2 Dataset di Distribuzione Empirica di T_IQO_P per Casi Sintomatici di 70-79 Anni con T=1 in OUTPUT (SALVATE come "Distribuzione_IQO_P_70-79_Sintomatici_1.csv")

data_inizio	data_fine	T	T_IQO_P	frequenza_T_IQO_P
01-03-2020	01-03-2020	1	0	0
01-03-2020	01-03-2020	1	1	0
01-03-2020	01-03-2020	1	2	4
01-03-2020	01-03-2020	1	3	NA
01-03-2020	01-03-2020	1	4	NA
01-03-2020	01-03-2020	1	5	0
01-03-2020	01-03-2020	1	0	0
01-03-2020	01-03-2020	1	1	0
01-03-2020	01-03-2020	1	2	NA
02-03-2020	02-03-2020	1	3	NA
02-03-2020	02-03-2020	1	4	NA
02-03-2020	02-03-2020	1	5	0

6.3 Dataset di Distribuzione Empirica di T_IQO_P per Casi Confermati di 70-79 Anni sintomatici con T=2 in OUTPUT (SALVATE come "Distribuzione_IQO_P_70-79_Sintomatici_2.csv")

data_inizio	data_fine	T	T_IQO_P	frequenza_T_IQO_P
01-03-2020	02-03-2020	2	0	0
01-03-2020	02-03-2020	2	1	0
01-03-2020	02-03-2020	2	2	5
01-03-2020	02-03-2020	2	3	4
01-03-2020	02-03-2020	2	4	5
01-03-2020	02-03-2020	2	5	0

7. Schede di Dimissione Ospedaliera (SDO) e di Morte (SM)

Obiettivi

• Stimare le infezioni latenti nel periodo pre-sorveglianza necessarie ad inizializzare alcune variabili e parametri dei modelli di simulazione che dovranno poi essere calibrati sulle incidenza stratificate per età e sequenza estratti come descritto nelle sezioni precedenti;
• Analisi degli eccessi di evento notevole (ammissioni, decessi, etc.) stratificato per causa anche volta a determinare eventuali casi COVID-19 mis-diagnosticati.

Sintesi

I codici che riportiamo qui di seguito andrebbero utilizzati per costruire un dataset analogo alla sezione 5. Sequenze stratificato per età e per aggregazione di codici di causa nel periodo 2015-2020.

Come si legge nella sezione ministeriale sui ricoveri ospedalieri:

• il sistema di codifica utilizzato per le SDO è l'ICD-9;
• il sistema di codifica utilizzato per le SM è l'ICD-10.

Poiché le SM risultano disponibili soltanto fino al 2018 ci siamo trovati costretti a considerare soltanto le SDO nell'analisi descritta qui di seguito.

Età

La classificazione d'età è la medesima descritta nella sezione 0. Età.

Codici

Al fine di selezionare i codici ICD-10 da convertire mediante il nostro pacchetto ICD_GEMs.jl nei corrispondenti codici ICD-9 rilevanti abbiamo condotto una rapid review della letteratura con un'attenzione particolare rivolta alle analisi delle schede di morte (SM) registrate in Italia. Questa revisione supporta la scelta del set di codici assegnati a complicazioni e comorbosità associate a COVID-19 che riportiamo qui di seguito.

Cause Concorrenti O Precipitanti O Antecedenti

Codici ICD-10	Descrizione	Referenze
U071, U072	COVID-19	Grippo et al. (2020) ; Fedeli et al. (2021) ; Grande et al. (2021)
U071, U072, J09-J189, J80, J849, J96x	COVID-19 + Flu, pneumonia + selected respiratory diseases	Fedeli et al. (2021)
A00-B99	Infectious and parasitic diseases	Grippo et al. (2020) ; Grippo et al. (2021)
A40–A41	Sepsis	CDC-NCHS (2022)
A40-A41, B37, B49, B99	Sepsis and infections of unspecified site	Orsi et al. (2021)
C00-D48	Neoplasms	Grippo et al. (2020) ; Grippo et al. (2021) ; Fedeli et al. (2021) ; Orsi et al. (2021)
C00-C96	Neoplasms	Grande et al. (2021)
C00–C97	Malignant neoplasms	CDC-NCHS (2022)
E00–E90	Endocrine, nutritional, and metabolic diseases	Grande et al. (2021)
E00-E99	Endocrine, nutritional and metabolic diseases of which	Grippo et al. (2020)
E10-E14	Diabetes	Grippo et al. (2020) ; Grippo et al. (2021) ; CDC-NCHS (2022) ; Fedeli et al. (2021) ; Grande et al. (2021)
E66	Obesity	Grippo et al. (2021)
E86-E87	Volume depletion and other fluid disorders	Orsi et al. (2021)
G30, G31, F01, F03	Dementia and Alzheimer	CDC-NCHS (2022)
F00–F99	Mental and behavioral disorders	Grande et al. (2021)
F00-F03, G30-G31	Dementia and Alzheimer's disease	Orsi et al. (2021)
F03, G30	Dementia and Alzheimer’s disease	Grande et al. (2021)
F01-F03, G30	Dementia and Alzheimer	Grippo et al. (2020) ; Grippo et al. (2021) ; Fedeli et al. (2021)
G00-H99	Diseases of the nervous system (excluding Alzheimer)	Grippo et al. (2020)
I00-I99	Diseases of the circulatory system of which	Grippo et al. (2020) ; Fedeli et al. (2021)
I10-I15	Hypertensive heart diseases	Grippo et al. (2020) ; Grippo et al. (2021) ; CDC-NCHS (2022) ; Fedeli et al. (2021) ; Grande et al. (2021) ; Orsi et al. (2021)
I20-I24	Acute ischemic heart diseases	Orsi et al. (2021)
I20-I25	Ischaemic heart diseases	Grippo et al. (2020) ; Grippo et al. (2021) ; CDC-NCHS (2022) ; Fedeli et al. (2021)
I26	Pulmonary embolism	Orsi et al. (2021)
I48	Atrial fibrillation	Grippo et al. (2020) ; Fedeli et al. (2021)
I50	Heart failure	CDC-NCHS (2022)
I50-I51	Heart failure and other cardiac diseases	Orsi et al. (2021)
I60-I69	Cerebrovascular diseases	Grippo et al. (2020) ; Grippo et al. (2021) ; CDC-NCHS (2022) ; Fedeli et al. (2021)
J00-J99	Diseases of the respiratory system of which	Grippo et al. (2020) ; Grippo et al. (2021) ; Grande et al. (2021)
I00-I09, I90-I99	Other circulatory diseases	Orsi et al. (2021)
J00–J06, J20–J39, J60–J70, J80–J86, J90–J96, J97–J99, R09.2, U04	Other diseases of the respiratory system	CDC-NCHS (2022)
I00–I99	Diseases of the circulatory system	Grande et al. (2021)
I00–I09, I26–I49, I51, I52, I70–I99	Other disease of the circulatory system	CDC-NCHS (2022)
J09–J18	Influenza and pneumonia	CDC-NCHS (2022) ; Grande et al. (2021)
J09-J189	Flu, Pneumonia	Fedeli et al. (2021)
J40-J47	Chronic lower-respiratory diseases	Grippo et al. (2020) ; Grippo et al. (2021) ; CDC-NCHS (2022) ; Fedeli et al. (2021) ; Orsi et al. (2021)
J80, J849, J96x	Selected respiratory diseases	Fedeli et al. (2021)
J81	Pulmonary oedema	Orsi et al. (2021)
J00-J11, J30-J39, J60-J70, J82-J848, J85-J99	Other diseases of the respiratory system	Orsi et al. (2021)
K00-K99	Diseases of the digestive system	Grippo et al. (2020)
K70, K73, K74	Chronic liver diseases	Fedeli et al. (2021)
K70-K77	Chronic liver diseases	Grippo et al. (2021)
N17–N19	Renal failure	Grippo et al. (2021) ; CDC-NCHS (2022) ; Orsi et al. (2021)
N18	Chronic renal failure	Orsi et al. (2021)
R00-R99	Symptoms, signs, unspecified	Fedeli et al. (2021) ; Grande et al. (2021)
R570-R571, R573-R579	Shock	Orsi et al. (2021)
S00-T98	External causes	Grippo et al. (2020) ; Grippo et al. (2021)

Complicazioni

Codici ICD-10	Descrizione	Referenze
A00-A09	Intestinal infections	Grippo et al. (2020)
A00–A09, K50–K67	Intestinal complications	Grippo et al. (2021)
A00-B99	Some infectious diseases	Grippo et al. (2020)
A40-A41, A49, B34, B37, B44, B99	Sepsis and bacterial infections of unspecified site	Grippo et al. (2020)
A40–A41, A49, B25–B49, B99, R572	Sepsis, septic shock, and infections	Grippo et al. (2021)
C00-D48	Neoplasms	Grippo et al. (2020)
D50-D99	Diseases of blood and blood forming organs	Grippo et al. (2020)
E10-E14	Endocrine diseases	Grippo et al. (2020)
E40-E46	Nutritional disorders	Grippo et al. (2020)
E66	Obesity	Grippo et al. (2020)
E70-E90	Other diseases of the metabolism	Grippo et al. (2020)
E86	Dehydration	Grippo et al. (2021)
F00-F99	Mental and behavioural disorders	Grippo et al. (2020)
G00-H99	Other diseases of the nervous system	Grippo et al. (2020)
G04, G93	Encephalitis, myelitis and encephalomyelitis	Grippo et al. (2020) ; Grippo et al. (2021)
I00-I09, I27-I45, I47, I52	Specified cardiac diseases	Grippo et al. (2020)
I10-I5	Hypertensive heart diseases	Grippo et al. (2020)
I20-I24	Myocardial infarction	Grippo et al. (2020)
I21	Acute myocardial infarction	Grippo et al. (2021)
I25	Chronic ischaemic heart disease	Grippo et al. (2020)
I26	Pulmonary embolism	Grippo et al. (2020) ; Grippo et al. (2021)
I70-I79, I83-I89, I95-I99	Other circulatory diseases	Grippo et al. (2020)
I46	Cardiac arrest	Grippo et al. (2020)
I48-I49	Atrial fibrillation and other arrhythmias	Grippo et al. (2020)
I50-I51	Heart complications (heart failure and unspecified cardiac disease)	Grippo et al. (2020) ; Grippo et al. (2021)
I60-I64	Acute cerebrovascular accidents	Grippo et al. (2020) ; Grippo et al. (2021)
I80-I82	Phlebitis, thrombophlebitis and thrombosis of peripheral vessels	Grippo et al. (2020)
J00-J99	Other respiratory diseases	Grippo et al. (2020)
J12-J18, J84, J98	Pneumonia	Grippo et al. (2020)
J12-J18, J849	Pneumonia	Orsi et al. (2021)
J80-J81	ARDS and pulmonary oedema	Grippo et al. (2020) ; Grippo et al. (2021)
J80	Adult respiratory distress syndrome (ARDS)	Orsi et al. (2021)
J960, J969	Respiratory failure	Orsi et al. (2021)
J96, R04, R06, R09	Respiratory failure and related symptoms	Grippo et al. (2020)
K00-K99	Other diseases of the digestive system	Grippo et al. (2020)
K50-K67	Other diseases of intestine and peritoneum	Grippo et al. (2020)
K70-K77	Chronic liver diseases	Grippo et al. (2020)
M00-M99	Diseases of the musculoskeletal system and connective tissue	Grippo et al. (2020)
N00, N04, N17, N19	Kidney failure	Grippo et al. (2020)
N17, N19	Renal failure	Grippo et al. (2021)
N00-N99	Other diseases of the genitourinary system	Grippo et al. (2020)
R04-R09	Symptoms and signs involving the respiratory system	Orsi et al. (2021)
R57	Shock	Grippo et al. (2020)
R57 (excluding R572)	Shock (cardiogenic)	Grippo et al. (2021)
R65	Systemic inflammatory response syndrome (SIRS)	Orsi et al. (2021)
S00-T98, V01-Y98	External causes	Grippo et al. (2020)