feat: make scripts portable across unix systems

backend/geonature/utils/command.py

@@ -57,20 +57,20 @@ def create_frontend_module_config(module_code, output_file=None):
 
 
 def nvm_available():
-    return run(["/bin/bash", "-i", "-c", "type -t nvm"], stdout=DEVNULL).returncode == 0
+    return run(["/usr/bin/env bash", "-i", "-c", "type -t nvm"], stdout=DEVNULL).returncode == 0
 
 
 def install_frontend_dependencies(module_frontend_path):
     cmd = ["npm", "ci", "--omit=dev", "--omit=peer"]
     if nvm_available():
         with (FRONTEND_DIR / ".nvmrc").open("r") as f:
             node_version = f.read().strip()
-        cmd = ["/bin/bash", "-i", "-c", f"nvm exec {node_version} {' '.join(cmd)}"]
+        cmd = ["/usr/bin/env bash", "-i", "-c", f"nvm exec {node_version} {' '.join(cmd)}"]
     run(cmd, check=True, cwd=module_frontend_path)
 
 
 def build_frontend():
     cmd = ["npm", "run", "build"]
     if nvm_available():
-        cmd = ["/bin/bash", "-i", "-c", f"nvm exec {' '.join(cmd)}"]
+        cmd = ["/usr/bin/env bash", "-i", "-c", f"nvm exec {' '.join(cmd)}"]
     run(cmd, check=True, cwd=str(FRONTEND_DIR))

data/migrations/2.0.1to2.1.0.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 # faux sudo car sinon la commande "sudo -n -u" ne le demande pas
 sudo ls

data/migrations/2.4.0to2.4.1_insert_departments.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 filepath=$(realpath $0)
 GEONATURE_ROOT=$(dirname $(dirname $(dirname $filepath)))
@@ -16,4 +16,4 @@ export PGPASSWORD=$user_pg_pass;psql -h $db_host -U $user_pg -d $db_name -f $GEO
 sudo -n -u postgres -s psql -d $db_name -c "DROP TABLE ref_geo.temp_fr_departements;" &>> $GEONATURE_ROOT/var/log/insert_departements.log
 
 rm $GEONATURE_ROOT/tmp/geonature/departement_admin_express_2020-02.zip
-rm $GEONATURE_ROOT/tmp/geonature/fr_departements.sql
+rm $GEONATURE_ROOT/tmp/geonature/fr_departements.sql

data/migrations/missing_grid.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 . ../../config/settings.ini
 cd ../../
 

data/migrations/v1tov2/migratetoV2.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#! /bin/bash
+#! /usr/bin/env bash
 . migratetoV2.ini
 . ../../../config/settings.ini
 echo $geonature1user

data/migrations/v1tov2/my_organisme/mymigratetoV2.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#! /bin/bash
+#! /usr/bin/env bash
 . ../migratetoV2.ini
 . mymigratetov2.ini
 . ../../../../config/settings.ini

data/migrations/v1tov2/old/v1_compat.sh.old

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 . v1_compat.ini
 . ../../../config/settings.ini

data/scripts/backup/pgdump2ftpbackup.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 BKPDIR="/var/backups/pgsql"
 TODAY=`date +%F`

data/scripts/import_ginco/import_ca.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 . settings.ini
 # export all variable in settings.ini

data/scripts/import_ginco/import_mtd.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 . settings.ini
 # export all variable in settings.ini

data/scripts/import_ginco/import_taxref/import_new_taxref_version.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 . ../settings.ini
 
 mkdir -p /tmp/taxhub

data/scripts/import_ginco/restore_db.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 # Scripts qui restaure une BDD GINCO à parit d'un DUMP SQL
 # Puis crée un Foreign Data Wrapper entre la base restaurée et la base GeoNature cible 

data/scripts/ref_geo/insert_reg.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 filepath=$(realpath $0)
 GEONATURE_ROOT=$(dirname $(dirname $(dirname $filepath)))
@@ -15,4 +15,4 @@ export PGPASSWORD=$user_pg_pass;psql -h $db_host -U $user_pg -d $db_name -f $GEO
 sudo -n -u postgres psql -d $db_name -c "DROP TABLE ref_geo.temp_fr_regions;" &>> $GEONATURE_ROOT/var/log/insert_reg.log
 
 # rm $GEONATURE_ROOT/tmp/geonature/reg_fr_admin_express_2020-07.zip
-rm $GEONATURE_ROOT/tmp/geonature/fr_regions.sql
+rm $GEONATURE_ROOT/tmp/geonature/fr_regions.sql

data/scripts/sensi/import_sensi_depobio.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 # Script remplaçant les règles de sensibilité nationales et régionales intégrées dans GeoNature, par les règles départementales.
 # Utilisé pour DEPOBIO pour disposer des règles de sensibilité à jour, au niveau départemantal.

install/00_install_nvm.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 
 echo "Installation de nvm"

install/01_install_backend.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 # DESC: Usage help
 # ARGS: None

install/02_configure_systemd.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 
 set -eo pipefail

install/03_create_db.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 
 set -eo pipefail

install/04_install_gn_modules.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 set -eo pipefail
 

install/05_install_frontend.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 # DESC: Usage help
 # ARGS: None

install/06_configure_apache.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 SCRIPT_DIR="$( cd "$( dirname "${BASH_SOURCE[0]}" )" &> /dev/null && pwd )"
 . "${SCRIPT_DIR}/utils"

install/install_all/install_all.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 set -e
 

install/migration/beta4tobeta5.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#/bin/bash
+#/usr/bin/env bash
 
 BASE_DIR=$(readlink -e "${0%/*}")
 

install/migration/migration.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 SERVICES=("geonature" "geonature-worker" "taxhub" "usershub")
 

install/utils

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 
 export BASE_DIR=$(dirname "${SCRIPT_DIR}")

lint.sh

@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/bin/bash
+#!/usr/bin/env bash
 
 # backend
 black .