diff --git a/docs/japanR2024/index.html b/docs/japanR2024/index.html index de9b52d..7ae7c73 100644 --- a/docs/japanR2024/index.html +++ b/docs/japanR2024/index.html @@ -424,7 +424,7 @@

自己紹介

jinseob2kim@gmail.com, github.com/jinseob2kim

中国での映像やブログレビュー

@@ -597,6 +607,19 @@

中国での映像やブログレビュー

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@@ -610,11 +633,37 @@

1~2行のコードだけで分析ウェブを作れるよう、各分析機能をモジュールとして開発

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論文支援実績

SCI論文200編以上支援

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論文支援実績

  • 6つの大学病院と年単位研究支援契約、10のバイオ会社の臨床試験分析支援
  • -
    + +

    無料統計ウェブ

    国家R&D選定

    @@ -654,12 +729,38 @@

    国家R&D選定

    +

    著作権登録

    +

    オープンソース管理

    @@ -674,12 +775,38 @@

    オープンソース管理

    +

    オープンソースライセンス検証

    +

    R package: Shiny -> exe

    @@ -687,6 +814,19 @@

    R package: Shiny -> exe

    +

    Rコミュニティ: Shinykorea

    @@ -716,6 +856,19 @@

    オープンソースの寄与:インターンシップ

    +

    教育

    @@ -727,6 +880,19 @@

    教育

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    With TokyoR

    @@ -738,6 +904,19 @@

    With TokyoR

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    要約

    diff --git a/docs/japanR2024/index.qmd b/docs/japanR2024/index.qmd index d562050..4e6363a 100644 --- a/docs/japanR2024/index.qmd +++ b/docs/japanR2024/index.qmd @@ -204,8 +204,8 @@ sex Overall 228 100 1.91 1.14 3.2 100 100 0.014 ``` ::: notes -次はjstableです。 このパッケージは回帰分析結果を論文用テーブルにしてくれるパッケージで、単変量分析、univariate analysis結果を一緒に見せてくれるのが特徴です。 回帰分析、GLM、Cox、Linearmixed model、GEE、Survey glm、survey coxなど様々な回帰モデルをサポートします。 下のコードにあるように、glmshow.displayはGLM結果を示す関数です。 -츠기와 제에에스티이에에비이에루이이데스 코노 팟케에지와 카이키분세키켓카오 론분요오테에부루니 시테쿠레루 팟케에지데 탄헨료오분세키 유우니붸리이아토 아나리시스켓카오 잇쇼니 미세테쿠레루노가 토쿠초오데스 카이키분세키 지이에루에무 시이옷쿠스 리니이아아밋쿠스토 모데루 지이 사아베이 지이에루에무 사아베이 콧쿠스나도 사마자마나 카이키모데루오 사포오토시마스 시타노 코오도니 아루요오니 지이에루에무에스에에치오오다부류우 디스푸레에와 지이에루에무켓카오 시메스 칸스우데스 + +jstable만의 기능으로 subgroup analysis가 있는데요, 같은 분석을 성별, 나이 등 서브그룹에 따라 수행하고 Interaction P value를 보여줍니다. 이 테이블과 forestplot 패키지를 이용하면 의학논문에서 흔히 이용되는 forestplot을 그릴 수 있습니다. ::: @@ -222,6 +222,15 @@ sex Overall 228 100 1.91 1.14 3.2 100 100 0.014 ::: ::: + +::: notes + +이 subgroup analysis 기능은 중국연구자들이 많이 이용중이며, 블로그와 영상으로 많이 리뷰되었습니다. jstable 패키지 issue 내용의 80% 이상이 중국 의학연구자들로부터의 요청입니다. + +::: + + + ##
    @@ -238,11 +247,25 @@ sex Overall 228 100 1.91 1.14 3.2 100 100 0.014 ::: ::: +::: notes + +마지막으로 jsmodule입니다. jskm, jstable 내용을 포함해 의학통계에서 많이 이용되는 분석기능들을 Shiny module로 만들고, 이 모듈들을 모아 로컬에서 실행할 수 있는 Shiny App 을 만들었습니다. Shiny App은 총 5종류로 일반데이터용, Survey data용, GEE를 적용한 반복측정데이터용, 마지막으로 인과추론 분석방법인 Propensity score mathching과 IPTW 를 수행할 수 있는 Shiny App 입니다. 각 분석기능은 독립적으로 Shiny module로 개발되었으므로, 누구나 자신의 Shiny app에 적용할 수 있습니다. +::: + + ## ![](그림1.png) +::: notes + +이것은 jskm을 Shiny module로 만든 것이며, 그림은 PPT로 다운받아 직접 편집할 수 있습니다. officer과 rvg 패키지를 이용했습니다. +::: + + + + ## 論文支援実績 SCI論文200編以上支援 @@ -252,6 +275,10 @@ SCI論文200編以上支援 ![](그림2.png) +::: notes +저희 회사에서는 이 패키지들을 이용해 의학연구를 지원하고 있으며, 세계 3대 의학저널인 NEJM, LANCET, JAMA 포함 200편 이상의 SCI 논문에 필요한 분석을 지원하였습니다. 한국의 6개 대학병원과 연단위 계약을 수행중이며, 10개이상 제약회사의 임상시험 데이터분석을 지원중입니다. +::: + ## 無料統計ウェブ - よく利用される分析機能を無料で分析できるopenstat.ai 公開 @@ -271,6 +298,13 @@ SCI論文200編以上支援 ::: ::: +::: notes +연구자들이 R 패키지 설치없이도 웹에서 이용할 수 있도록 하기 위해 openstat.ai를 출시하였습니다. 연구자는 자신의 데이터를 업로드하여 jsmodule의 4가지 Shiny app을 이용할 수 있습니다. 메타분석, 샘플수계산을 위한 Shiny app도 이용할 수 있습니다. +::: + + + + ## 国家R&D選定 3件の国家R&D支援事業を通じて技術開発および医学研究用の高度化を遂行 @@ -287,10 +321,22 @@ SCI論文200編以上支援 - 医学研究用&臨床試験 + +::: notes +저희 패키지는 한국에서 3건의 R&D 지원을 받아 개발 및 의학연구/임상시험용 고도화를 수행하였습니다. +::: + + + + ## 著作権登録
    +::: notes +R&D 지원을 통해 소프트웨어 저작권을 등록했으며 +::: + ## オープンソース管理 ::: columns @@ -309,16 +355,34 @@ Github action ::: ::: + +::: notes +자체 개발한 파이썬 streamlit 기반 대시보드를 이용해 깃허브 활성화 정도를 실시간으로 체크할 수 있으며, 모든 패키지는 Github action을 통해 에러체크, 홈페이지 업데이트, 코드 스타일링, 라이선스 동의가 자동으로 수행됩니다. + +::: + ## オープンソースライセンス検証
    +::: notes +모든 패키지는 나라에서 지원하는 오픈소스라이선스검증 프로그램을 이용해, 라이선스 문제가 없음을 검증받았습니다. + +::: + + ## R package: Shiny -\> exe R必要なくexeファイルにしてローカル環境で実行 - [executablePackeR](https://github.com/ChangwooLim/executablePackeR)
    + +::: notes +폐쇄 인터넷망 및 R패키지 설치가 어려운 병원들을 위해, Shiny app을 exe파일로 만들어주는 R패키지를 만들어 크랜에 공개하였습니다. 이 패키지를 이용하면 exe 파일의 실행만으로 shiny app을 이용할 수 있으며, 알블로거에도 소개되었습니다. +::: + + ## Rコミュニティ: Shinykorea ::: columns @@ -350,6 +414,13 @@ R必要なくexeファイルにしてローカル環境で実行 - [executablePa ::: ::: + +::: notes +저희 회사는 학생 인턴십을 활발히 운영중으로, 현재 통계학과 학생, 의대생, 의사 포함 7명이 인턴십을 수행 중입니다. 인턴십 과정을 통해 R패키지 업데이트에 기여하고 있으며, 기여가 큰 인턴은 크랜에 공동개발자로 추가하였습니다. +::: + + + ## 教育 成均館大学校バイオヘルス規制科学科兼任教授講義 @@ -360,6 +431,13 @@ R必要なくexeファイルにしてローカル環境で実行 - [executablePa
    +::: notes +저희 회사는 주기적으로 R 교육을 수행하고 있으며, 저는 한국의 성균관대학교 바이오헬스규제과학과의 겸임교수를 맡아 "의학연구를 위한 R 데이터분석" 이라는 주제로 1년간 강의를 수행하였습니다. 한국의 공공의료빅데이터를 이용해 실습을 수행하였으며 모든 강의자료와 코드, 그리고 동영상 강의를 깃허브에 업로드하였습니다. +::: + + + + ## With TokyoR - TokyoRミートアップ発表 @@ -370,6 +448,13 @@ R必要なくexeファイルにしてローカル環境で実行 - [executablePa > > +::: notes + +::: + + + + ## 要約 - 医学研究用Rパッケージの開発、日本/中国で活用 diff --git a/docs/osfestival/index.html b/docs/osfestival/index.html index d1f54b3..5eb45e6 100644 --- a/docs/osfestival/index.html +++ b/docs/osfestival/index.html @@ -547,7 +547,7 @@

    논문지원 실적

    SCI 논문 200편이상 지원

    @@ -634,7 +634,7 @@

    오픈소스기여: 인턴십

    diff --git a/docs/osfestival/index.qmd b/docs/osfestival/index.qmd index 58e7859..dbbedbd 100644 --- a/docs/osfestival/index.qmd +++ b/docs/osfestival/index.qmd @@ -323,7 +323,7 @@ R없이 exe 파일로 로컬실행 - [executablePackeR](https://github.com/Chang ::: columns ::: {.column width="50%"} -- 정기적 선발발 +- 정기적 선발 ![](intern.png) :::