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c005 |
apresentação de campanha |
0.2.0 |
DRAFT |
0 |
no endorsement |
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Objetivo: levantamento sistemático dos artigos sobre Zika e análise OpenCoherence do subconjunto de artigos disponível em full-text JATS.
Inicio: 2017-08-06
- Ricardo Barros Sampaio (rsampaio.br@gmail.com - UnB)
- Peter Krauss (ppkrauss - Open Knowledge Brasil)
- Jorge H. C. Fernandes (jhcf@unb.br - UnB)
- ... estamos aguardando a sua participação!
Na presente campanha elegeu-se o tema Zika por ser um dos temas de maior relevância para a Fiocruz em 2017, e por não ter sido realizado, até o momento, um levantamento sistemático do "acervo JAST" em torno deste tema. Também em 2017 foi implementada na Fiocruz uma política de dados abertos, e durante sua implementação surgiram questionamentos quanto à efetividade da publicação de pesquisas em revistas abertas.
Não existem trabalhos que comprovem causa-efeito do grau de abertura de um acervo de conhecimento científico, justamente porque não existem métricas objetivas para esse "grau de abertura". O alvo da campanha é portanto o cálculo de grau de abertura deste acervo JATS temático, tanto para aferição nos artigos individuais como nos artigos em conjunto.
Quanto à disponibilidade e avaliação das licenças livres em artigos formatados em JATS, um importante estudo foi realizado em 2013, "Inconsistent XML as a Barrier to Reuse of Open Access Content", com subprodutos e ferramentas mantidos até hoje na Wikipedia, tendo sua metodologia e sucesso motivado também a presente campanha.
Artigos científicos indexados em bases de dados abertas, como PubMed Central e SciELO, têm acesso gratuito e garantido por décadas. Esses bancos de dados são considerados repositórios de acesso aberto, nos quais o ato de registro assume uma licença aberta.
Para aqueles que esperam fazer pleno uso do documento (ler, entender, reutilizar e redistribuir), o direito de acesso expresso pela licença pode ser insuficiente. Idealmente, o mesmo direito de acesso seria observado aos anexos, figuras e tabelas, bem como nos documentos citados e referenciados. O documento depende destes objetos (seus componentes internos e documentos externos que cita), mas eles possuem suas próprias licenças.
Para o usuário do documento, as licenças das dependências não devem apresentar restrições adicionais ao uso: este é o princípio sobre o qual reside o conceito de OpenCoherence, isto é, a coerência da licença de um documento com as licenças de sua dependências.
O projeto, iniciado com apoio da Open Knowledge Brasil em 2015, já determinava uma métrica para o cálculo de grau de abertura em documentos JATS, de modo que foi natural a sua extensão no Observatório JATS.
Ao declarar emergência internacional de saúde pública com o surto do vírus Zika, a OMS propiciou o surgimento de um novo momento para a Ciência no campo da saúde, a aceleração da geração de conhecimento para atender a uma epidemia.
Aparentemente essa aceleração garantiu a publicação de conteúdos com licenças abertas, principalmente entre 2016 e 2017; no entanto, essa aceleração, mesmo tendo gerado conteúdos com licenças abertas na maior parte dos casos, não parece ter resultado no mesmo grau de abertura nas dependências dos artigos, principalmente porque o tema recar citação de obras de áreas diferentes, fora desse universo mais aberto e dos efeitos da aceleração. Portanto é esperada a observação de nítida perda de coerência de abertura para as obras sobre Zika deste período.
O levantamento sistemático requer garantia de .. e .. precisão e completeza (fig).. Resumindo num pass-a-passo
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Preparo dos critérios e contexto histórico: o termo Zika virus se tornou um "padrão de facto" para a rotulação do tema, o que permite o uso eficiente de por palavra-chave. Em termos históricos sabe-se que o Zika não era conhecido antes da epidemia deflagrada em 2016, e que sua descoberta não pode ter sido anterior à década de 2000.
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Levantamento do acervo de artigos sobre o tema: busca nas principais fontes de indexação de artigos científicos.
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Normalização dos identificadores dos artigos (por DOI ou PMCID).
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... artigos OpenAccess (artigos de revistas que receberam o selo DOAJ) ...
A grosso modo o universo foi obtido de uma busca no PMC (link do engine?) com
"zika" or "ZIKV" or "zikavirus"
que resultou na listagem pmc_result-zikaFull-2017-08.csv de 2506 artigos.
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Critério de exclusão para confirmar que o artigo versa sobre Zika: abstract ou palavras-chave fixadas pelo autor devem conter termos-chave.
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Critério para confirmação: média de referências por artigo que citam demais artigos do "grupo Zika".
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Efeitos da amostragem: ao reduzir o universo aos artigos OpenAccess, não haveria apenas uma redução no tamanho da amostra, mas também efeitos sobre a distribuição do assunto. Um dos efeitos relavantes e mensuráveis seria a diversidade. Usando os índices de Pielou para equitativodade e de Simpsom para dominância, pode-se caracterizar com precisão o comportamento médio de amostras aleatórias, e o efeito do filtro OpenAccess.
Considera-se amostra o artigo JATS que apresente minimamente:
- tags gerais
<front>,<back>e<body> frontcom confirmação do ISSN da revista onde foi resgatado.frontcom tag<permission>para que possa ser avaliado o grau de abertura do artigo, mesmo que apenas confirmando a licença default da revista.bodycom volume mínimo de texto e mínomo de seções, conforme padrões mínimos de um research article.backcom mais de uma referência na sua<ref-list>.
... ver refs e melhoras ...
... ver refs e melhoras ...
...
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