Atom type guessing error when parse gro file

[pillose]

Expected behavior

When I try to parse following gro file using MDAnalysis.Universe,

Example gro file

mCP
 52
       1LIG        C00        1      1.382      1.369      3.583    0.0621  -0.1579  -0.3177
       1LIG        C01        2      1.516      1.408      3.551    0.2861    0.3115  -0.4733
       1LIG        C02        3      1.335      1.406      3.711  -0.1396    0.1043  -0.6418
       1LIG        C03        4      1.413      1.470      3.804    0.2561    0.2800    0.2722
       1LIG        C04        5      1.603      1.465      3.646  -0.9943    0.1843  -0.0949
       1LIG        C05        6      1.547      1.498      3.773    0.0720    0.3654    0.5643
       1LIG        H06        7      1.705      1.487      3.617  -2.1881  -1.6600    1.6244
       1LIG        H07        8      1.326      1.312      3.512  -0.1227    1.6765    3.4071
       1LIG        H08        9      1.373      1.505      3.904  -2.8380    0.2915    0.0254
       1LIG        H09      10      1.609      1.543      3.847  -0.9918    0.6125    0.1841
       1LIG        N0A      11      1.569      1.360      3.423    0.7252    0.4807    0.1006
       1LIG        N0B      12      1.199      1.378      3.753    0.0195    0.6945  -0.3455
       1LIG        C0C      13      1.511      1.382      3.298  -0.0718    0.0881    0.4777
       1LIG        C0D      14      1.693      1.291      3.403  -0.8847    0.5669  -0.3861
       1LIG        C0E      15      1.079      1.390      3.677    0.1428  -0.3040  -0.4933
       1LIG        C0F      16      1.157      1.323      3.880  -1.2695    0.3701    0.7727
       1LIG        C0G      17      0.967      1.354      3.754    0.1120  -0.1261    0.2826
       1LIG        C0H      18      1.019      1.302      3.872    0.6453    0.4619  -0.6466
       1LIG        C0I      19      1.706      1.270      3.258  -0.1344    0.4492    0.3150
       1LIG        C0J      20      1.595      1.327      3.198  -0.3651    0.3864    0.9254
       1LIG        C0K      21      1.563      1.348      3.060    0.0239    0.2715    1.5069
       1LIG        C0M      22      1.395      1.451      3.278    0.3359    0.8552    0.0206
       1LIG        C0N      23      1.820      1.205      3.211  -0.8869    0.1811    0.0699
       1LIG        C0O      24      1.784      1.254      3.501    0.2992  -0.1149  -0.4235
       1LIG        C0P      25      1.084      1.464      3.558    0.0214  -0.0379    0.1615
       1LIG        C0Q      26      0.839      1.378      3.699  -0.0488    0.1386  -0.0709
       1LIG        C0R      27      1.239      1.285      3.989    0.3367  -0.1765  -0.0590
       1LIG        C0S      28      0.957      1.237      3.982    0.1652    0.3390  -0.8689
       1LIG        C0T      29      1.175      1.229      0.053  -0.1744    0.0147  -0.0595
       1LIG        C0U      30      1.035      1.198      0.045  -0.0222    0.4244  -0.4755
       1LIG        C0V      31      0.951      1.491      3.510    0.2775  -0.1529    0.3318
       1LIG        C0W      32      0.832      1.442      3.573    0.1285  -0.4091  -0.5051
       1LIG        C0X      33      1.440      1.413      3.035    0.0008    0.2347  -0.2036
       1LIG        C0Y      34      1.357      1.470      3.141  -0.4632    1.0063  -0.2381
       1LIG        C0Z      35      1.913      1.162      3.309  -0.7378    0.4248  -0.2854
       1LIG        C10      36      1.894      1.177      3.450    0.3427    0.6086  -0.1384
       1LIG        H11      37      1.835      1.181      3.105  -0.3026  -1.0577    1.3633
       1LIG        H12      38      1.990      1.094      3.274    0.8838  -3.0362  -3.3538
       1LIG        H13      39      1.767      1.282      3.603    1.5678    0.4610    0.1510
       1LIG        H14      40      1.965      1.147      3.523    2.8042    0.8007    1.6468
       1LIG        H15      41      1.618      1.301      2.980  -2.3607  -1.0238    1.5835
       1LIG        H16      42      1.411      1.434      2.933  -0.4707  -0.3738  -0.3861
       1LIG        H17      43      1.353      1.498      3.365  -0.1283    2.4331    0.5324
       1LIG        H18      44      1.263      1.521      3.117  -2.4200  -1.8720    1.1648
       1LIG        H19      45      0.952      1.545      3.415    0.9236  -0.1758    0.1509
       1LIG        H1A      46      1.179      1.495      3.515    0.6316    0.7709  -1.4005
       1LIG        H1B      47      0.742      1.462      3.523  -0.4545    0.5913  -0.5083
       1LIG        H1C      48      0.749      1.363      3.760    0.4201    1.1105    2.4743
       1LIG        H1D      49      1.347      1.280      3.982  -1.0797    0.6533    0.4476
       1LIG        H1E      50      1.230      1.205      0.144    0.4106    1.5828    1.9807
       1LIG        H1F      51      0.995      1.147      0.137    1.2287    0.4955    1.6285
       1LIG        H1G      52      0.847      1.214      3.994  -0.4029  -1.2299    1.5198

type of atoms must be following:

Expected result

'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'H'
'H'
'H'
'H'
'N'
'N'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'

Actual behavior

However, what I actually get is:

Actual result

'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'H'
'H'
'H'
'H'
'NA'
'N'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'CS'
'C'
'CU'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'C'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'
'H'

Code to reproduce the behavior

import MDAnalysis as mda
gro = mda.Universe('prod.gro')  #Example gro file
mol = gro.residues[0]

for atom in mol.atoms:
    atom.type

Current version of MDAnalysis

• MDAnalysis : 2.5.0
• Python : 3.11.3
• operating system : Rocky Linux