diff --git a/plugins/circular-view/src/BaseChordDisplay/models/renderReaction.ts b/plugins/circular-view/src/BaseChordDisplay/models/renderReaction.ts index a77fc7c616..e734b0e6a9 100644 --- a/plugins/circular-view/src/BaseChordDisplay/models/renderReaction.ts +++ b/plugins/circular-view/src/BaseChordDisplay/models/renderReaction.ts @@ -52,7 +52,6 @@ export async function renderReactionEffect(props?: any, stopToken?: string) { const { html, ...data } = await rendererType.renderInClient(rpcManager, { ...renderArgs, ...renderProps, - stopToken, exportSVG, stopToken, }) diff --git a/plugins/linear-comparative-view/src/LGVSyntenyDisplay/model.ts b/plugins/linear-comparative-view/src/LGVSyntenyDisplay/model.ts index ed9994da20..1d8a1576bb 100644 --- a/plugins/linear-comparative-view/src/LGVSyntenyDisplay/model.ts +++ b/plugins/linear-comparative-view/src/LGVSyntenyDisplay/model.ts @@ -119,12 +119,13 @@ function stateModelFactory(schema: AnyConfigurationSchemaType) { } session.setSelection(feature) }, + /** + * #autorun + */ afterCreate() { // use color by stand to help indicate inversions better on first load, // otherwise use selected orientation - if (self.colorBy) { - self.setColorScheme({ ...self.colorBy }) - } else { + if (!self.colorBySetting && self.colorBy.type === 'normal') { self.setColorScheme({ type: 'strand' }) } }, diff --git a/plugins/sequence/src/BgzipFastaAdapter/__snapshots__/BgzipFastaAdapter.test.ts.snap b/plugins/sequence/src/BgzipFastaAdapter/__snapshots__/BgzipFastaAdapter.test.ts.snap index 4257eb2030..78a52f2651 100644 --- a/plugins/sequence/src/BgzipFastaAdapter/__snapshots__/BgzipFastaAdapter.test.ts.snap +++ b/plugins/sequence/src/BgzipFastaAdapter/__snapshots__/BgzipFastaAdapter.test.ts.snap @@ -7,7 +7,7 @@ exports[`can use a indexed fasta with gzi 1`] = ` "refName": "ctgA", "seq": 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